MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp3

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021992	CCA	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232690
2	NC_021992	CG	3	6	2780	2785	0 %	0 %	50 %	50 %	529232690
3	NC_021992	CAC	2	6	2916	2921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232690
4	NC_021992	TTG	2	6	2929	2934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232690
5	NC_021992	CAT	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232690
6	NC_021992	GCT	2	6	2995	3000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232690
7	NC_021992	CCGG	2	8	3012	3019	0 %	0 %	50 %	50 %	529232690
8	NC_021992	TGA	2	6	3029	3034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232690
9	NC_021992	TGCA	2	8	3039	3046	25 %	25 %	25 %	25 %	529232690
10	NC_021992	GAC	2	6	3437	3442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232691
11	NC_021992	T	6	6	3444	3449	0 %	100 %	0 %	0 %	529232691
12	NC_021992	CAGG	2	8	3450	3457	25 %	0 %	50 %	25 %	529232691
13	NC_021992	A	6	6	3461	3466	100 %	0 %	0 %	0 %	529232691
14	NC_021992	GGC	2	6	3537	3542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232691
15	NC_021992	GCAC	2	8	3571	3578	25 %	0 %	25 %	50 %	529232691
16	NC_021992	CAT	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232691
17	NC_021992	GAT	2	6	3676	3681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232691
18	NC_021992	GGC	2	6	3733	3738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232691
19	NC_021992	CG	3	6	3778	3783	0 %	0 %	50 %	50 %	529232691
20	NC_021992	GAAAG	2	10	3820	3829	60 %	0 %	40 %	0 %	529232691
21	NC_021992	CAGA	2	8	3853	3860	50 %	0 %	25 %	25 %	529232692
22	NC_021992	AGAGC	2	10	3974	3983	40 %	0 %	40 %	20 %	529232692
23	NC_021992	GGC	2	6	4031	4036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232692
24	NC_021992	CTCTGG	2	12	4044	4055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232692
25	NC_021992	CGC	2	6	4103	4108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232692
26	NC_021992	CCG	2	6	4190	4195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232692
27	NC_021992	GCC	3	9	4662	4670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232693
28	NC_021992	GAT	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232693
29	NC_021992	TGC	2	6	4712	4717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232693
30	NC_021992	GATCTC	2	12	4814	4825	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	529232693
31	NC_021992	GCGCG	2	10	4917	4926	0 %	0 %	60 %	40 %	529232693
32	NC_021992	GCC	2	6	4992	4997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232693
33	NC_021992	TCT	2	6	5024	5029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232693
34	NC_021992	CAGC	2	8	5039	5046	25 %	0 %	25 %	50 %	529232693
35	NC_021992	GGTAT	2	10	6098	6107	20 %	40 %	40 %	0 %	529232694
36	NC_021992	TGT	2	6	6127	6132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232694
37	NC_021992	CCT	2	6	6142	6147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529232694
38	NC_021992	GCA	2	6	6163	6168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232694
39	NC_021992	A	7	7	6250	6256	100 %	0 %	0 %	0 %	529232694
40	NC_021992	TCG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232694
41	NC_021992	CAG	2	6	6424	6429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232694
42	NC_021992	CGA	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232694
43	NC_021992	CATC	2	8	6585	6592	25 %	25 %	0 %	50 %	529232694
44	NC_021992	CGC	2	6	6593	6598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232694
45	NC_021992	GCC	2	6	6615	6620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232694
46	NC_021992	ATTGC	2	10	6622	6631	20 %	40 %	20 %	20 %	529232694
47	NC_021992	ATG	2	6	6675	6680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232694
48	NC_021992	ATT	2	6	6699	6704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232694
49	NC_021992	ACG	2	6	6727	6732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232694
50	NC_021992	CT	3	6	6784	6789	0 %	50 %	0 %	50 %	529232694
51	NC_021992	A	6	6	6803	6808	100 %	0 %	0 %	0 %	529232694
52	NC_021992	GAT	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232694
53	NC_021992	ATC	2	6	6870	6875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232694
54	NC_021992	TCA	2	6	6924	6929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232694
55	NC_021992	CAT	2	6	7037	7042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232694
56	NC_021992	GAA	2	6	7090	7095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232694
57	NC_021992	TCA	2	6	7110	7115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232694
58	NC_021992	TTGT	2	8	7502	7509	0 %	75 %	25 %	0 %	529232695
59	NC_021992	CA	3	6	7531	7536	50 %	0 %	0 %	50 %	529232695
60	NC_021992	CAG	3	9	7561	7569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232695
61	NC_021992	ATG	2	6	7619	7624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232695
62	NC_021992	ACA	2	6	7647	7652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232695
63	NC_021992	GCC	2	6	7689	7694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232695
64	NC_021992	GAG	2	6	7717	7722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529232695
65	NC_021992	AGGC	2	8	7744	7751	25 %	0 %	50 %	25 %	529232695
66	NC_021992	CCG	2	6	7774	7779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232695
67	NC_021992	GGTC	2	8	7813	7820	0 %	25 %	50 %	25 %	529232695
68	NC_021992	CG	3	6	8490	8495	0 %	0 %	50 %	50 %	529232696
69	NC_021992	GCA	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232696
70	NC_021992	CCAGA	2	10	8508	8517	40 %	0 %	20 %	40 %	529232696
71	NC_021992	CGCT	2	8	8525	8532	0 %	25 %	25 %	50 %	529232696
72	NC_021992	GCG	2	6	8592	8597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232696
73	NC_021992	GAGAT	2	10	8669	8678	40 %	20 %	40 %	0 %	529232696
74	NC_021992	CGGGCC	2	12	8735	8746	0 %	0 %	50 %	50 %	529232696
75	NC_021992	CG	3	6	8830	8835	0 %	0 %	50 %	50 %	529232696
76	NC_021992	CG	3	6	8911	8916	0 %	0 %	50 %	50 %	529232696
77	NC_021992	ACC	2	6	8944	8949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232696
78	NC_021992	ACAA	2	8	9236	9243	75 %	0 %	0 %	25 %	529232697
79	NC_021992	T	7	7	9284	9290	0 %	100 %	0 %	0 %	529232697
80	NC_021992	A	6	6	9291	9296	100 %	0 %	0 %	0 %	529232697
81	NC_021992	TTA	2	6	9354	9359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232697
82	NC_021992	GCC	2	6	9366	9371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232697
83	NC_021992	TA	3	6	9424	9429	50 %	50 %	0 %	0 %	529232697
84	NC_021992	TA	3	6	9561	9566	50 %	50 %	0 %	0 %	529232697
85	NC_021992	AT	3	6	9656	9661	50 %	50 %	0 %	0 %	529232697
86	NC_021992	ATA	2	6	9666	9671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232697
87	NC_021992	GAT	2	6	9675	9680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232697
88	NC_021992	AT	3	6	9679	9684	50 %	50 %	0 %	0 %	529232697
89	NC_021992	A	7	7	9694	9700	100 %	0 %	0 %	0 %	529232697
90	NC_021992	ATT	2	6	9711	9716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232697
91	NC_021992	GGT	2	6	9735	9740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232697
92	NC_021992	TATT	2	8	9779	9786	25 %	75 %	0 %	0 %	529232697
93	NC_021992	TGA	2	6	9875	9880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232697
94	NC_021992	TTAC	2	8	9892	9899	25 %	50 %	0 %	25 %	529232697
95	NC_021992	GCT	2	6	9942	9947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232697
96	NC_021992	GAT	2	6	9972	9977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232697
97	NC_021992	AT	3	6	9976	9981	50 %	50 %	0 %	0 %	529232697
98	NC_021992	TGG	2	6	10017	10022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232697
99	NC_021992	CGT	3	9	10041	10049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232697
100	NC_021992	GGA	2	6	10050	10055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529232697
101	NC_021992	TTA	2	6	10079	10084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232697
102	NC_021992	AAT	2	6	10118	10123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232697
103	NC_021992	CCG	2	6	10183	10188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232697
104	NC_021992	AGA	2	6	10209	10214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232697
105	NC_021992	CTTTT	2	10	10288	10297	0 %	80 %	0 %	20 %	529232697
106	NC_021992	GC	3	6	10396	10401	0 %	0 %	50 %	50 %	529232697
107	NC_021992	CCCG	2	8	10649	10656	0 %	0 %	25 %	75 %	529232697
108	NC_021992	CGAC	2	8	10664	10671	25 %	0 %	25 %	50 %	529232697
109	NC_021992	GAA	3	9	10673	10681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232697
110	NC_021992	CGA	2	6	10832	10837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232697
111	NC_021992	TCA	2	6	10864	10869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232697
112	NC_021992	TCA	2	6	10993	10998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232697
113	NC_021992	AAGA	2	8	11025	11032	75 %	0 %	25 %	0 %	529232697
114	NC_021992	TGCG	2	8	11049	11056	0 %	25 %	50 %	25 %	529232697
115	NC_021992	GTC	2	6	11058	11063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232697
116	NC_021992	ATG	2	6	11105	11110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232697
117	NC_021992	GCG	2	6	11184	11189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232698
118	NC_021992	CTG	2	6	11231	11236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
119	NC_021992	TGG	2	6	11240	11245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232698
120	NC_021992	TCCA	2	8	11283	11290	25 %	25 %	0 %	50 %	529232698
121	NC_021992	CTG	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
122	NC_021992	ATC	2	6	11414	11419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232698
123	NC_021992	A	6	6	11428	11433	100 %	0 %	0 %	0 %	529232698
124	NC_021992	TGC	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
125	NC_021992	CG	3	6	11528	11533	0 %	0 %	50 %	50 %	529232698
126	NC_021992	TCG	2	6	11565	11570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
127	NC_021992	AGA	2	6	11743	11748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232698
128	NC_021992	CGGC	2	8	11766	11773	0 %	0 %	50 %	50 %	529232698
129	NC_021992	CAT	2	6	11776	11781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232698
130	NC_021992	AGA	2	6	11809	11814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232698
131	NC_021992	TTC	2	6	11889	11894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232698
132	NC_021992	GCG	2	6	11955	11960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232698
133	NC_021992	ACG	2	6	12006	12011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232698
134	NC_021992	CCGG	2	8	12156	12163	0 %	0 %	50 %	50 %	529232698
135	NC_021992	TCG	2	6	12192	12197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
136	NC_021992	CGC	2	6	12403	12408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232698
137	NC_021992	TCG	2	6	12471	12476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
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139	NC_021992	TGC	2	6	12636	12641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232698
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142	NC_021992	CTT	2	6	12707	12712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232698
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154	NC_021992	CTAT	2	8	13578	13585	25 %	50 %	0 %	25 %	529232698
155	NC_021992	GGC	2	6	13613	13618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232698
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171	NC_021992	ACCC	2	8	14594	14601	25 %	0 %	0 %	75 %	529232699
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173	NC_021992	TGA	2	6	14628	14633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232699
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182	NC_021992	TCT	2	6	15181	15186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232700
183	NC_021992	TCC	2	6	15225	15230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529232700
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.